Spatiaalinen analyysi on tietosuojan kannalta erityisen haastava, koska sijaintitieto on usein keskeinen tieto yksilön tunnistamisen kannalta. Spatiaalisen analyysin tulosten julkaiseminen edellyttää yleensä sijaintitiedon uudelleenluokittelua ja esittämistä lämpökarttoina yksittäisten havaintopisteiden sijaan.